Оренбургская духовная семинария была основана 26 августа 1884 года, вновь воссоздана определением Священного Синода Русской Православной Церкви (Московский Патриархат) 27 мая 2009 года (Журнал заседаний № 38).
Семинария расположена в историческом центре г. Оренбурга, имеются благоустроенное общежитие, библиотека с просторным читальным залом и самым большим фондом православной литературы в Оренбургской области, Интернет-класс и все необходимые условия для учёбы, занятий спортом, творчеством и активного отдыха.
Семинария располагает необходимой материально-технической базой, обеспечивающей проведение всех видов занятий, в том числе и практик, предусмотренных образовательными программами. Лекционные занятия проводятся в аудиториях, укомплектованных техническими средствами обучения, демонстрационным оборудованием: экранами, проекторами, компьютерами.
Для всех обучающихся обеспечен индивидуальный неограниченный доступ к учебно-планирующей и учебно-методической документации: учебным планам, рабочим программам дисциплин (модулей), программам практик, к ресурсам электронных библиотечных систем и другим материалам, обеспечивающим реализацию образовательных программ через электронную образовательную среду.
Студентам бесплатно предоставлен беспроводной доступ к сети Интернет посредством Wi-Fi. Также студенты могут воспользоваться кабинетами для самостоятельной работы, оснащенными необходимым компьютерным оборудованием, доступом к сети Интернет.
Библиотечный фонд укомплектован печатными и электронными изданиями основной и дополнительной учебной, научной и художественной литературы. В семинарии создана среда, способствующая обучению и воспитанию учащихся. Социокультурная среда семинарии направлена на удовлетворение потребностей и интересов личности в соответствии с общечеловеческими и национальными ценностями и представляет собой пространство, которое способно изменяться под воздействием субъектов, культивирующих и поддерживающих определенные ценности, отношения, традиции, правила и нормы в различных сферах и формах жизнедеятельности коллектива семинарии.
В семинарии имеются объекты социальной и спортивной инфраструктуры: актовый зал, помещения для индивидуальной работы студентов, объекты спорта.
Храм, освященный в честь Трех Святителей, является центром семинарской жизни. Здесь будущие священники учатся на деле тому, что будет главным в их жизни – молитве и богослужению. Каждую неделю студенты духовной школы участвуют в богослужении. Особое внимание уделяется чёткому исполнению Богослужебного Устава Православной Церкви. На клиросном послушании семинаристы учатся церковному пению и чтению. Студенты поочерёдно помогают в храме, следя за ходом священнодействий, совершаемых в алтаре. Священнослужители помогают в решении вопросов, возникающих у семинаристов. Кроме того, учащиеся несут послушания в храмовой ризнице семинарском хоре.